はい、連携されます。
USEN SMART RESERVE（スマリザ）がグルメサイトから取り込んだ「ポイント利用情報」は、そのまま連携しているUSENレジ側へ自動で引き継がれます。
そのため、店舗様がUSENレジで会計を開いた際、すでにポイント分の値引きや利用情報が反映された（または紐づいた）状態でスムーズに会計を行うことができます。

各グルメサイトごとのUSEN SMART RESERVEへの取り込みルート（連携状況）は以下の通りです。

① 食べログ
対象ポイント：Vポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：「ポイント利用」へ自動連携
② ぐるなび
対象ポイント：ぐるなびポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：「ポイント利用」へ自動連携
③ HOT PEPPER（レストランボード / Air ID）
対象ポイント：Pontaポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：「ポイント利用」へ自動連携
④ 一休
 対象ポイント：一休ポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：「ポイント利用」へ自動連携
⑤ OZmall
 対象ポイント：OZポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：機能なし
⑥ Retty
 対象ポイント：なし
サイトコントローラー：ポイントなし
メール勝手取り込み：機能なし
⑦PayPayグルメ
対象ポイント：PayPayポイント
サイトコントローラー：「ポイント利用」へ自動連携
メール勝手取り込み：機能なし

▼USENレジの設定方法
支払いに「予約サイトポイント」を追加する方法

①USEN レジの管理画面へログイン後、 TOP画面より店舗管理＞店舗個別管理＞支払科目種設定を押下

TOP画面のメニュータブより「店舗管理」＞「店舗個別管理」＞「支払科目種設定」を押
下します。

②店舗を選択し、検索＞新規登録を押下
店舗を選択後、「検索」し「新規登録」を押下します。

③予約サイトポイントにチェック をし、登録を押下
ポイント内の予約サイトポイントにチェック を入れ、「登録」を押下します。
設定後はUSEN レジで必ずマスタ同期を実施してください。

※ポイントの種類をUSENレジでは確認することはできません。