USENレジ側で「配席処理を行ってから、テーブルグループ（統合）を設定した」ことが原因かもしれません。
配席後にテーブルグループを設定してしまうと、予約連携エラー（POS画面に「時間が重複する予約情報が存在します。SMART RESERVE画面をご確認ください。」と表示）が発生し、
グルメサイトからの予約が未配席のまま取り込まれてしまいます。

▼正しい基本フロー
１．USENレジにて、対象テーブルのテーブルグループ（統合）を設定する
２．グループ化の完了を確認してから配席処理を行う
３．お客様をテーブルへご案内する

このような場合は、ダブルブッキングを防ぐため、以下の3ステップで対応してください。
・タイムテーブルの確認
SMART RESERVE（予約台帳）および各グルメサイトの管理画面を開き、タイムテーブルを確認します。
・空き枠（予約受付可能箇所）の特定
すでに統合済みで現在接客中であるにもかかわらず、システムの仕様上「予約受付可能」になってしまっているテーブルがないか探します。
・予約ブロックの設定
該当するテーブル・時間帯が存在する場合は、すぐに「予約ブロック」を入れて空席枠を塞いでください。